冷库的仓库是食品冷藏加工和长期存放的地方，仓库的卫生管理是整个冷库卫生管理的中心环节。在仓库里，霉菌比细菌繁殖得快，容易损坏食物。

所以仓库要不定期消毒。手推车等载货设备也可成为食品微生物污染的媒介，应经常清洗消毒。冷藏仓库中的食物，无论是否包装，都应放在滑道上。滑道应抛光并保持清洁。垫木、手推车等设备应定期在冷库外清洗消毒。

可用热水洗涤，用2％碱水（50）脱脂，用含0.3％~0.4％有效氯溶液消毒。所有加工设备，如铁锅、挂钩、桌子等。使用前后应先用清水冲洗干净，必要时用热碱水消毒。冷库内的走道、楼梯要经常清理，特别是进出冷库时，碎肉等残留物要及时清理，避免污染环境。